Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms