Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNIKQ9UKE5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms