Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBE1Q9UJT0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms