Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms