Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms