Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms