Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms