Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOR4AQ9NXH8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms