Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf109Q9NX04 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms