Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms