Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms