Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LTBP3Q9NS15 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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LTBP3Q9NS15 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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