Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS45Q9NRW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms