Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms