Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDHAF3Q9NRP4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms