Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms