Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A4GALTQ9NPC4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A4GALTQ9NPC4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms