Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA1Q9NP55 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA1Q9NP55 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms