Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD42

CHMP1A, Charged multivesicular body protein 1a, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1AQ9HD42 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHMP1AQ9HD42 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms