Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms