Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms