Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ARL9-201ENST00000360096 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SENP3Q9H4L4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms