Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms