Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP44Q9C0F1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms