Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ROPN1BQ9BZX4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms