Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDEM3Q9BZQ6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDEM3Q9BZQ6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDEM3Q9BZQ6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EDEM3Q9BZQ6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms