Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR2Q9BYE9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms