Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FANCD2Q9BXW9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
FANCD2Q9BXW9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms