Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VN1R3Q9BXE9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms