Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms