Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRIP1Q9BX63 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms