Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms