Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms