Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FTH1P10-201ENST00000401830 930 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01090-201ENST00000415357 881 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OVCH1-AS1-201ENST00000549411 743 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOCP33-201ENST00000603716 632 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC18-201ENST00000374160 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CIDEB-203ENST00000554411 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136181.1-201ENST00000454484 1924 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TAAR6-201ENST00000275198 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MT1B-201ENST00000334346 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP168-201ENST00000410910 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 FRG2FP-202ENST00000419104 559 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 CARM1P1-201ENST00000426329 1185 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012494.1-201ENST00000439259 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092944.1-203ENST00000488040 567 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093297.2-202ENST00000514597 659 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105118.1-201ENST00000523002 544 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002512.2-201ENST00000532561 623 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02327-206ENST00000551588 885 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105109.1-201ENST00000556012 1115 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms