Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP4Q99569 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms