Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORT1Q99523 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms