Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GCNAQ96QF7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms