Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3IPQ96QF0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms