Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLIN4Q96Q06 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN4Q96Q06 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms