Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRERF1Q96PN7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRERF1Q96PN7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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