Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COG8Q96MW5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms