Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JSRP1Q96MG2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms