Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP53Q96M91 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms