Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

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Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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