Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGBD1Q96JS3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms