Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms