Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms