Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L3HYPDHQ96EM0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
L3HYPDHQ96EM0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms