Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP3Q96DZ5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLIP3Q96DZ5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms