Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCTD12Q96CX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCTD12Q96CX2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms